Руководство ОАО «Гайский ГОК» обеспечивает реализацию курса на увеличение объемов производства и повышение качества продукции. В связи с этим на предприятии активно внедрялись и внедряются передовые научные технологии. Это касается как добычи руды, так и  ее переработки. Впервые в горной практике, именно на Гайском ГОКе был создан и применен комбинированный способ разработки месторождения, когда выемка руды ведется одновременно открытым и подземным способами в одной вертикальной плоскости. В 2001 году комбинат приступил к внедрению циклично-поточной технологии добычи руды, пока единственной в России. Это «скоростная схема»: очистной забой – погрузодоставочная машина – конвейер – скиповой подъем. Циклично-поточная технология сокращает затраты на транспортировку руды на 14%,  и дальнейшее ее  развитие позволит сэкономить, по сравнению с проектным вариантом, более 50 млн рублей.

Впервые в стране на открытом руднике ОАО «Гайский ГОК» было применено наклонное бурение взрывных скважин, и вот уже десятки лет оно является единственным способом бурения, что позволило горнякам улучшить дробление руды при взрывании скважин и сократить простои автотранспорта при их отгрузке на 15%.

В 2004 году на комбинате применено сепарационное оборудование, способное отделять руду от пустой породы, что по расчетам специалистов значительно сократит затраты  на перевозку руды,  и позволит качественно улучшить процесс ее переработки.

В 2008 году на обогатительной фабрике приступили к установке новой комплексной системы управления технологическими объектами с новым программным обеспечением «АСУ ТП @JUST» . Управление технологическим процессом измельчения и обогащения руды, контроль за состоянием оборудования, осуществляется через операторскую, где на экранах многочисленных компьютеров отслеживаются поступающие параметры. Руководство и технологический персонал фабрики также могут наблюдать за технологическим процессом через свои персональные компьютеры. Оператор всегда находится на телефонной или селекторной связи с руководством и технологическим персоналом. Для связи с удалёнными участками фабрики, куда не достаёт телефонная связь есть радиостанция. Внедрение новой АСУТП связано с масштабной реконструкцией обогатительной фабрики Гайского ГОКа. Как сообщалось ранее, в результате реконструкции, объемы производства по переработке руды планируется увеличить с 5 – до 8 млн. тонн в год, а также улучшить качество выпускаемых концентратов.